1、在結構和材料上不同，混合式電機內部具有永久磁性材料，故混合式電機有自阻（即在電機未加電的情況下有一定的自鎖力），而反應式電機沒有自阻。
2、在運行性能上有差別，混合式電機運行時相對較平穩，輸出力矩相對較大，運行聲音小。
3、兩種電機在價格上有差別，反應式電機相對混合式電機而言要便宜。
反應式步進電機采用高導磁材料構成齒狀轉子和定子，其結構簡單，生產成本低，步距角可以做的相當小，但動態性能相對較差，轉矩較小。

混合式步進電機是指混合了永磁式和反應式的優點。其轉子采用齒狀的稀土永磁材料，定子則為齒狀的突起結構。步距角小，出力大，動態性能好，是性能較好的一類步進電動機，目前市場上多用此類電機。運控公司生產的全部是混合式步進電機，尤其向用戶推薦三相混合式步進電機，三相混合式步進電機抖動小，噪音低，精度高，性價比高。最受歡迎的是兩相混合式步進電機，約占97%以上的市場份額，其原因是性價比高，配上細分驅動器后效果良好。該種電機的基本步距角為1.8°/步，配上半步驅動器后，步距角減少為0.9°，配上細分驅動器后其步距角可細分達256倍（0.007°/微步）。由于摩擦力和制造精度等原因，實際控制精度略低。同一步進電機可配不同細分的驅動器以改變精度和效果。